Struktur kepengurusan Kopontren Bina Alhasani Indonesia sebagai berikut:
- Pembina : Pengasuh Pondok Pesantren Salaf Alhasani
- Pengawas : Dra. Zahroul Mufida, M.Pd
- Ketua : Azzhan Shahrul, M.Pd
- Sekretaris : Nafidatul Ilmiyah, S.Pd
- Bendahara : Innanie Nabila
- Karyawan : Achmad Salim, S,Pd – Fitrah, S.Pd – Achmad Firdaus Khusnul Khotimah
Kepengurusan Kopontren Bina Alhasani Indonesia melibatkan unsur masyarakat di sekitar pondok pesantren serta para alumni Pondok Pesantren Salaf Alhasani. Keterlibatan tersebut diharapkan dapat memperkuat peran dan keberadaan Kopontren di tengah masyarakat. Selain berorientasi pada pengembangan usaha, Kopontren Bina Alhasani Indonesia juga menjalankan fungsi sosial kemasyarakatan.